公开课 | 肠道菌群在胃肠道疾病、慢病、精神类疾病上的研究进展、方向与趋势
【2020-06-15】
直播时间：2020年6月18日（周四）19:30
已结束
近年，肠道菌群研究在众多疾病类型上取得了丰硕的成果，部分成果进入了转化应用阶段。尤其在胃肠道疾病、慢病和精神类疾病研究上，关注度非常高。肠道菌群在疾病领域的研究模式大致可分为肠道菌群和疾病关系研究、疾病标志物筛找、疾病治疗、宿主关联分析和单一菌种研究五大方向。
本次直播课选择3个重要的临床疾病领域：胃肠道疾病、慢病和精神类疾病，深度剖析17篇近期SCI文章，从思路、实验设计和技术应用来阐述肠道菌群研究在上述三大细分领域的研究内容、方向和趋势。助力领域客户更好地完成实验设计，发表高分文章。
公开课时间
2020年6月18日（周四）19:30
公开课内容
1.疾病关系、标志物筛找、疾病治疗、宿主关联、单一菌种，五大方向怎么走？
2.【胃肠道疾病】对实验设计、分析和方法提出了更高要求
3.【精神类疾病】高分洼地，疾病关系仍是主流
4.【慢病】机制初探明，下步做突破
5.领域项目征集计划，k8凯发基因助力领域新突破
【胃肠道疾病/肿瘤研究】——对实验设计、分析和方法提出了更高要求
直播将解析以下文章思路与实验设计：
案例预告
· 研究内容：幽门螺旋杆菌感染对胃肠道微生物影响研究——基于山东省临朐县胃癌高发区的一项人群研究
· 发表时间：2019
· 发表期刊：Gut(IF:17)
实验设计思路图
Guo, Yang, et al. "Effect of Helicobacter pylori on gastrointestinal microbiota: a population-based study in Linqu, a high-risk area of gastric cancer." Gut (2019).
文章亮点评述
1.取样地点选取山东省临朐县，第一时间当地居民饮食结构上保持因素单一，其次该县为胃癌高发地，具有很高的研究意义；
2.同时采集粪便与胃粘膜样本进行相互对比，更贴合疾病类型，以得出新颖结论；
3.研究分析逻辑清晰，结果明确。
胃肠道疾病/肿瘤疾病研究方向进展与趋势
① 疾病关系研究趋势
a. 样本类型是关键，贴合实验目的，不同样本相互验证
b. 关联已不足以说明问题，正向因果关系探究转变
c. 测序方法升级宏基因组，多组学/临床指标要齐加入
② 疾病Biomarker筛找研究趋势
a. 实验规模再提升，纯数据分析更是如此
b. Biomarker寻找从菌属到菌种再到菌株
c. 菌种+基因功能+代谢产物，多组学marker分辨率更高
③ 疾病治疗研究趋势
a. 病人持续跟踪记录很有必要
b. 疾病研究最终要落到标志物上
c. 多因素/多指标研究成主流
④ 宿主关联研究趋势
a. 前沿方向，高分洼地
b. 人+菌双重分析，更好阐述疾病机制
c. 对生信提出高要求
【精神类疾病研究】——高分洼地，疾病关系研究仍是主流
直播将解析以下文章思路与实验设计
案例预告
· 研究内容：肠道微生物组有效鉴别重性抑郁障碍（MDD）和双相情感障碍（BD）
· 发表时间：2019
· 发表期刊：Advanced Science(IF:15.8)
实验设计思路图
Yachida, Shinichi, et al. "Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cancer." Nature medicine 25.6 (2019): 968-976.
文章亮点评述
1.创意新颖，先前研究少，且为临床真实需求，有重要意义；
2.前期大量样本挑选出疾病标志物后，有验证及样本完善实验设计。
疾病研究方向进展与趋势
① 疾病关系研究趋势
a. 疾病关系仍是精神类疾病研究主流，依然可发高分期刊
b. 多组学/指标联合分析崭露头角，尤其是神经递质检测
② 疾病Biomarker筛找研究趋势
a. 虽和胃肠道研究不在一个级别，但实验规模依然有待提升
b. 病人持续跟踪十分必要
c. 细分/特色类疾病类型深挖，可有奇效
d. 有待多组学biomarker共同分析
③ 疾病治疗研究趋势
a. 相关研究相对较少，机会尚存
b. 治疗方式待深入，实验设计待完善
④ 宿主关联分析研究
a. 相关研究较少，机会尚存
【慢病(心血管疾病、糖尿病)研究】——机制初探明，下步做突破
直播将解析以下文章思路与实验设计
案例预告
· 研究内容：高血压患者的肠道微生物和短链脂肪酸特征研究
· 发表时间：2020
· 发表期刊：Scientific Reports(IF:4.2)
实验设计思路图
Calderón-Pérez, Lorena, et al. "Gut metagenomic and short chain fatty acids signature in hypertension: a cross-sectional study." Scientific Reports 10.1 (2020): 1-16.
文章亮点评述
1.多样的取样类型和研究方法，相互关联验证，结果丰富；
2.探究粪便与血浆中短链脂肪酸差异，印证先前推测；
3.生信分析逻辑清晰明确。
疾病研究方向进展与趋势
① 疾病关系研究趋势
a. 疾病与肠道微生物关系初探明，尤其在心血管疾病领域
b. 因果关系研究是必然
c. 多组学/指标联合分析成为发表高分文章的必然
② 疾病Biomarker筛找研究趋势
a. 高分文章已经对实验规模提出了更高要求
b. 代谢组学已经凸显出重要意义，重磅文章频出
③ 疾病治疗研究趋势
a. 用药、手术、饮食等治疗方法与慢病息息相关，研究待深入
b. 特色疾病类型或成突破口
c. 治疗方式待深入，实验设计待完善
④ 宿主关联分析研究
a. 相关研究较少，机会尚存
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